A UEFS também é afiliada à ABRUEM (Associação Brasileira dos Reitores das Universidades Estaduais e Municipais), entidade criada em 1991, que é uma das mais importantes do Ensino Superior Brasileiro e da América Latina. A Abruem busca aprofundar permanentemente as discussões de temas prioritários para a agenda do Ensino Superior, sempre almejando a harmonia entre Ensino, Pesquisa, Extensão, Inovação e Internacionalização.
A Abruem igualmente é defensora da causa da internacionalização, promovendo anualmente diversas ações que envolvem missões ao exterior, acordos de cooperação, encontros diplomáticos e muito mais. A Abruem atua em favor da sociedade, em especial nas regiões mais carentes e junto às camadas da população que mais necessitam de apoio do sistema estadual e municipal de Educação Superior.
Filiada à ABRUEM, a UEFS faz parte da Câmara de Internacionalização e Mobilidade Acadêmica.
